Phân tích đa dạng di truyền bộ gen lục lạp ở bộ Loa kèn

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Hoàng Đăng Khoa Đỗ

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Nguyễn Tất Thành, 2022

Mô tả vật lý: tr.1

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 331044

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Bộ Loa kèn là một bộ thực vật một lá mầm và bao gồm cả loài thực vật tự dưỡng và dị dưỡng cộng sinh với nấm
phân bố rộng khắp hoặc cục bộ tại một số vùng nhất định. Trong nghiên cứu này, da dạng di truyền của bộ Loa kèn được khảo sát thông qua phân tích đa dạng nucleotide và thành phần các loại trình tự lặp trong bộ gen lục lạp. Kết quả phân tích đa dạng nucleotide cho thấy rất nhiều trình tự có biến động cao trong vùng trình tự đơn lớn (LSC) và vùng trình tự đơn nhỏ (SSC) trong khi vùng trình tự lặp đảo thì có mức biến động thấp. Mặc dù từng họ trong bộ Loa kèn có các trình tự biến động đặc trưng nhưng vùng trình tự rps15-ycf1 có biến động cao được tìm thấy hầu hết trong các bộ gen lục lạp. Trong bộ gen lục lạp của bộ Loa kèn, các trình tự lặp đơn giản (SSR) loại nucleotide đơn là loại phổ biến và hầu hết các trình tự SSR nằm ở vùng không mã hóa. Tương tự như vậy, các trình tự lặp dài cũng chủ yếu được tìm thấy ở vùng không mã hóa. Ngoài ra, trình tự lặp đảo là trình tự lặp phổ biến hơn so với trình tự lặp liên tục trong bộ gen lục lạp của bộ Loa kèn. Số lượng trình tự lặp dài cao nhất được tìm thấy trong bộ gen lục lạp của loài Corsia dispar trong khi trình tự lặp đơn giản được xác định nhiều nhất trong loài Smilax china. Các kết quả nghiên cứu đa dạng nucleotide và trình tự lặp sẽ cung cấp các thông tin nền tảng cho các nghiên cứu tiếp theo trong lĩnh vực di truyền quần thể, chỉ thị phân tử và lịch sử tiến hóa của bộ Loa kèn.Liliales is a monocotyledonous order and contains both photosynthetic and mycoheterotrophic species that distribute locally or worldwide. In this study, the genetic diversity of chloroplast genomes in Liliales was explored regarding their nucleotide diversity and repeated composition. The analysis of nucleotide diversity revealed various hotspots in large and small single-copy regions whereas the IR regions had low sequence divergence. Although each family has specific hotspots, the rps15-ycf1 region was commonly found as a highly variable area in the cpDNA of observed taxa. In the cpDNA of Liliales, mononucleotide simple sequence repeat (SSR) is the most common type. The majority of SSRs are located in non-coding regions. Similarly, more long repeats were found in non-coding areas than in coding sequences. Additionally, the complement repeat exceeds forward type in the cpDNA of Liliales. The highest number of long repeats was found in Corsia dispar whereas that of SSRs was detected in Smilax china. The results of nucleotide diversity and repeat analyses provided fundamental information for further studies on population genetics, molecular marker development and evolutionary history of Liliales

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR