QUAN HỆ TIẾN HÓA CỦA CoVs DỰA TRÊN RBD

 0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thế Quang Trương

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học - Đại học Văn Lang, 2022

Mô tả vật lý: tr.40

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 332491

Thu thập 15 trình tự RBD của CoVs từ cơ sở dữ liệu GenBank (NCBI, USA). Sắp hàng nhiều trình tự CoVs RBD, xây dựng cây tiến hóa và nhận diện được ba phân chi CoVs là Sarbecovirus, Merbecovirus và Embercovirus. Phân chi Sarbecovirus có khoảng cách tiến hóa xa đối với Embercovirus 2,48226 và Merbecovirus 2,19391. Trong phân chi Sarbecovirus, human SARS-CoV2 và pangolin CoV có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với tỷ lệ tương đồng từ 94,10 đến 98,79%. Tiếp đến là human SARS-CoV2 và human SARS-CoV với tỷ lệ tương đồng 87,68%. Human SARS-CoV2 và bat SARS-CoV, human SARS-CoV2 và bat CoV đều có tỷ lệ tương đồng 85,14%. Điều này cho thấy, Sarbecovirus CoVs có khả năng tiến hóa thay đổi phạm vi vật chủ khác nhau như dơi, tê tê và ngườiWe collected 15 RBD sequences of CoVs from the GenBank database (NCBI, USA). We solved the problem of multiple sequence alignment based on CoVs RBD, built an evolutionary tree and identified three CoVs subgenus Sarbecovirus, Merbecovirus and Embercovirus. The Sarbecovirus subgenus has a long evolutionary distance to Embercovirus 2.48226 and Merbecovirus 2.19391. In the Sarbecovirus subgenus, human SARS-CoV2 and pangolin CoV have the closest evolutionary relationship with the identity from 94.10 to 98.79 %. Next is human SARS-CoV2 and human SARS-CoV with the identity of 87.68 %. Human SARS-CoV2 and bat SARS-CoV, human SARS-CoV2 and bat CoV all had the identity of 85.14 %. This suggests that Sarbecovirus CoVs have the ability to evolve with different host ranges such as bat, pangolin and human
Tạo bộ sưu tập với mã QR

THƯ VIỆN - TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP.HCM

ĐT: (028) 36225755 | Email: tt.thuvien@hutech.edu.vn

Copyright @2024 THƯ VIỆN HUTECH