PHÂN TÍCH CÁC ĐỘT BIẾN TRÊN PROTEIN GAI CỦA CÁC DÒNG BIẾN THỂ SARS-COV-2

 0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thế Quang Trương

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học - Đại học Văn Lang, 2022

Mô tả vật lý: tr.77

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 332527

Ba mươi ba trình tự protein gai (S) của các biến thể SARS-CoV-2 và một trình tự S tham chiếu (QIC53213) được thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank, Hoa Kỳ. Kết quả sắp hàng hai trình tự S của từng biến thể SARS-CoV-2 với trình tự S tham chiếu nhận diện được bảy dòng biến thể SARS-CoV-2 Alpha, Beta, Gamma, Delta, Delta Plus, Iota, Kappa và chín dòng biến thể N1-N9 chưa có mã WHO. Các đột biến thường xảy ra trên S của các dòng biến thể SARS-CoV-2 với xác suất xuất hiện là D614G 39,29%, N501Y 14,29%, L452R 1,90%, P681R 10,71%, P681H 9,52%, E484K 8,33% và K417N 5,95%Thirty-three spike protein (S) sequences of the SARS-CoV-2 variants and a reference S sequence (QIC53213) were collected from the GenBank database, USA. We identified seven variant lines Alpha, Beta, Gamma, Delta, Delta Plus, Iota, Kappa and nine variant lines N1-N9 without WHO code using pairwise S sequence alignment of each SARS-CoV-2 variant and the reference S sequence. The most common mutations on the S of the SARS-CoV-2 variant lines with the occurrence probability are D614G 39.29%, N501Y 14.29%, L452R 1.90%, P681R 10.71% , P681H 9.52%, E484K 8.33% and K417N 5.95%
Tạo bộ sưu tập với mã QR

THƯ VIỆN - TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP.HCM

ĐT: (028) 36225755 | Email: tt.thuvien@hutech.edu.vn

Copyright @2024 THƯ VIỆN HUTECH