Pairwise S sequence alignment of each Omicron variant with the original variant (QIC53213), 51 mutations were identified on the spike protein S. In which, 15 mutations are common on RBD including G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y and Y505H with probability from 59.26 to 66.67%. Mutations on RBD increased the BFE binding free energy between RBD and ACE2 making the Omicron variant 10 times more infectious than the original variant. Mutations in the S spike protein, such as K417N, E484A, N501Y, D614G and Y505H make the Omicron variants less resistant to vaccines and 10 to 50% less virulent than the Delta variantSắp hàng hai trình tự của từng biến thể Omicron với biến thể gốc (QIC53213), nhận diện được 51 đột biến trên protein gai S. Trong đó, có 15 đột biến thường gặp trên RBD gồm: G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y và Y505H với xác suất xuất hiện từ 59,26 đến 66,67 %. Các đột biến trên RBD làm tăng năng lượng tự do liên kết BFE giữa RBD và ACE2 khiến biến thể Omicron dễ lây nhiễm hơn 10 lần so với biến thể gốc ban đầu. Các đột biến trên protein gai S, chẳng hạn K417N, E484A, N501Y, D614G và Y505H làm các biến thể Omicron ít có khả năng kháng vaccine và mức độ độc lực của biến thể Omicron ít hơn từ 10 đến 50 % so với biến thể Delta