QUAN HỆ TIẾN HÓA CỦA CÁC DÒNG PHỤ OMICRON

 0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thế Quang Trương

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học - Đại học Văn Lang, 2022

Mô tả vật lý: tr.112

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 338168

Thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank, Hoa Kỳ được 21 trình tự protein gai S của các biến thể Omicron SARS-CoV-2 và một trình tự S tham chiếu (QIC53213) của biến thể Gốc. Kết quả sắp hàng nhiều trình tự S đã nhận diện được ba dòng phụ Omicron là BA.1 (B.1.1.529.1), BA.2 (B.1.1.529.2) và BA.3 (B.1.1.529.3). Cả ba dòng phụ BA.1, BA.2 và BA.3 đều có quan hệ tiến hóa xa với dòng Gốc với khoảng cách lần lượt là 0,02410, 0,02225 và 0,02559. Hai dòng phụ BA.1 và BA.3 có quan hệ tiến hóa gần nhau nhất với khoảng cách 0,00438. Đặc biệt, dòng phụ BA.2 có quan hệ tiến hóa xa với các dòng phụ BA.1 và BA.3 với khoảng cách tương ứng là 0,01285 và 0,01078We collected 21 spike protein S sequences of the SARS-CoV-2 Omicron variants and one reference S sequence (QIC53213) of the Goc variant from the GenBank database, USA. We identified three Omicron sublineages BA.1 (B.1.1.529.1), BA.2 (B.1.1.529.2) and BA.3 (B.1.1.529.3) by multiple S sequence alignment. All three sublineages BA.1, BA.2 and BA.3 are distantly related to the Goc lineage with the distances of 0.02410, 0.02225 and 0.02559, respectively. Two sublineages BA.1 and BA.3 have the closest evolutionary relationship with a distance of 0.00438. In particular, the BA.2 sublineage has a distant evolutionary relationship with the sublineages BA.1 and BA.3 with the respective distances of 0.01285 and 0.01078
Tạo bộ sưu tập với mã QR

THƯ VIỆN - TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP.HCM

ĐT: (028) 36225755 | Email: tt.thuvien@hutech.edu.vn

Copyright @2024 THƯ VIỆN HUTECH