Bài nghiên cứu được thực hiện nhằm đánh giá tác động của cấu trúc vốn (CTV) đến lợi nhuận của các ngân hàng thương mại (NHTM) Việt Nam trong giai đoạn 2012–2020. Trong nghiên cứu này, biến đại diện cho CTV của NHTM là tiền gửi khách hàng và nợ phi tiền gửi, được đo lường bằng tiền gửi khách hàng trên tổng tài sản và nợ phi tiền gửi trên tổng tài sản. Sử dụng dữ liệu thứ cấp của 30 NHTM Việt Nam với kỹ thuật hồi quy Bayes thông qua thuật toán lấy mẫu Gibbs, kết quả hồi quy cho thấy tiền gửi khách hàng có tác động ngược chiều đến lợi nhuận của NHTM. Trong khi đó, nợ phi tiền gửi có tác động cùng chiều đến lợi nhuận của NHTM. Ngoài ra, các biến kiểm soát là quy mô ngân hàng, dư nợ cho vay, chi phí hoạt động có tác động tích cực trong khi lạm phát, tăng trưởng GDP có tác động tiêu cực đến lợi nhuận của NHTM.This study was conducted to assess the impact of capital structure (CTV) on profitability of Vietnamese commercial banks in the period 2012–2020. In this study, the variables representing the capital structure of commercial banks are customer deposits and non-deposit liabilities, which are measured by customer deposits to total assets and non-deposit liabilities to total assets respectively. Using secondary data of 30 Vietnamese commercial banks with Bayesian regression technique via Gibbs sampling algorithm, the results show that customer deposits has a negative impact on the profitability of commercial banks. Meanwhile, non-deposit liabilities has a positive impact on the profitability of commercial banks. In addition, the control variables including bank size, bank loan, and operating costs have positive effects, whereas inflation and GDP growth have negative effects on the profitability of commercial banks in Vietnam.