ĐẶC ĐIỂM CỦA VÙNG GENE trnL VÀ PHÂN TÍCH SỰ PHÁT SINH LOÀI Hoya parasitica (Roxb.) Wall. ex Wight

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thị Thu Hiền Phạm, Quang Tân Từ

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên, 2023

Mô tả vật lý: tr.316-323

Bộ sưu tập: Báo, Tạp chí

ID: 339824

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

In plants, finding specificity DNA barcodes for species identification is still tricky. Several chloroplast gene regions have been studied and proposed as DNA markers for species identification. The trnL gene region in the chloroplast genome consists of intron trnL(UAA) located between two exons in the large single-copy region and intron trnL(UAA), which is a hypervariable region. Hoya parasitica (Roxb.) Wight) of the Hoya genus is a precious herbal plant. H. parasitica leaves have been used to treat some diseases in humans. The question is, is it possible to use the trnL gene region as a barcode to identify H. parasitica species when the plant samples are deformed or in powder form? This study presents the results of characteristics of the trnL gene region by amplification and nucleotide sequencing method and analysis of molecular evolution using MEGAX
simultaneously suggests potential barcodes for species identification of H. parasitica. The isolation and nucleotide sequencing results showed that the trnL gene region was 829 bp in size. The phylogenetic tree was built based on 32 trnL sequences, showing species distributed in 5 groups and samples H. parasitica TN1 and H. pubicalyx distributed in the same group. The trnL gene region is proposed as a potential chloroplast DNA barcoding candidate for H. parasitica species identification.Ở thực vật, việc tìm kiếm mã vạch DNA đặc hiệu để định danh loài còn gặp nhiều khó khăn. Một số vùng gene lục lạp đã được nghiên cứu và đề xuất làm chỉ thị DNA sử dụng trong định danh loài. Vùng gene trnL trong hệ gene lục lạp gồm intron trnL(UAA) nằm giữa hai exon trong vùng sao chép đơn lớn và intron trnL(UAA) là vùng siêu biến. Hoya parasitica (Roxb.) Wight) thuộc chi Hoya là cây thảo dược quý. Lá H. parasitica đã được sử dụng để điều trị một số bệnh ở người. Vấn đề đặt ra là có thể sử dụng vùng gene trnL làm mã vạch để nhận diện loài H. parasitica khi các mẫu cây bị biến dạng hoặc ở dạng bột hay không? Nghiên cứu này trình bày kết quả xác định đặc điểm vùng gene trnLbằng phương pháp khuếch đại và giải trình tự nucleotide
phân tích sự tiến hóa phân tử bằng MEGAX
đồng thời đề xuất mã vạch tiềm năng để định danh loài H. parasitica. Kết quả phân lập và giải trình tự nucleotide cho thấy, vùng gene trnL có kích thước là 829 bp. Cây phát sinh gene được xây dựng dựa trên 32 trình tự trnL cho thấy các loài phân bố trong 5 nhóm và mẫu H. parasitica TN1 phân bố cùng một nhóm với H. pubicalyx. Vùng gene trnL được đề xuất là ứng cử viên mã vạch DNA lục lạp tiềm năng phục vụ nhận dạng loài H. parasitica.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR