NGHIÊN CỨU MỨC ĐỘ BIỂU HIỆN CỦA CÁC GEN LẶP TRONG HỌ NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NAC LIÊN QUAN ĐẾN ĐÁP ỨNG HẠN Ở CÂY LẠC (Arachis hypogaea)

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thị Thu Hương Bùi, Đức Hà Chu, Huy Giới Đồng, Phương Loan Hoàng, Việt Hồng La, Đăng Khoa Trần, Thị Thanh Huyền Trần, Văn Tiến Trần

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học - Trường Đại học Sư phạm Hà Nội: Khoa học Tự nhiên, 2023

Mô tả vật lý: tr.90

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 342135

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

NAC has been considered one of the largest transcription factor families in plant species. In peanut (Arachis hypogaea), 29 members of the AhNAC gene family have been identified and characterized. However, the information of their functions related to the mechanism of the stress response has been reported. In this study, a total of seven duplication events, which occurred from the segmental duplication, has been predicted in the AhNAC gene family in peanuts. The Ka\Ks ratios revealed that natural selection prevented the presence of the point mutations in the most duplicated genes, consequently, maintaining their structure and function during evolution. Based on the unrooted phylogenetic tree between AhNAC proteins in peanuts and 23 drought-responsive CaNAC in chickpea (Cicer arietinum), we proposed 12 members of the AhNAC that potentially share similar functions with well-characterized NAC in chickpea. Furthermore, various hormone- and drought-responsive cis-regulatory elements have been found in the promoter regions of these candidate genes. Re-analysis of the previous RNA-Seq demonstrated that the majority of the candidate AhNAC genes were responsive to the osmotic stress. Taken together, our study could provide an important foundation for further functional characterization towards the improvement of stress tolerance in peanuts.NAC là một trong những nhóm nhân tố phiên mã (transcription factor, TF) đặc trưng có số lượng thành viên lớn nhất ở thực vật. Ở loài lạc (Arachis hypogaea), 29 gen AhNAC đã được xác định và phân tích đặc tính cấu trúc. Tuy nhiên, chức năng của những gen này liên quan đến cơ chế chống bất lợi vẫn chưa được đề cập. Trong nghiên cứu này, tổng số bảy sự kiện lặp gen, bắt nguồn từ hiện tượng lặp đoạn trên các nhiễm sắc thể đã được dự đoán trong họ gen AhNAC ở lạc. Phân tích tỉ lệ Ka\Ks cho thấy chọn lọc tự nhiên đã kìm hãm sự xuất hiện của các đột biến điểm ở phần lớn các gen lặp, từ đó bảo tồn cấu trúc và chức năng của gen trong tiến hóa. Dựa trên sơ đồ hình cây giữa trình tự protein đầy đủ của NAC ở lạc và 23 NAC đáp ứng hạn ở đậu gà (Cicer arietinum) đã được xây dựng, 12 AhNAC đã được đề xuất chia sẻ chức năng tương tự như các TF NAC ở đậu gà. Hơn nữa, vùng promoter của các gen này được ghi nhận có nhiều nhóm yếu tố điều hòa cis- đáp ứng tín hiệu hormone và đáp ứng hạn. Khai thác dữ liệu RNA-Seq đã chứng minh đa số các gen đề xuất có biểu hiện đáp ứng trong điều kiện bất lợi thẩm thấu. Kết quả của nghiên cứu này đã cung cấp những dẫn liệu quan trọng cho phân tích chức năng gen nhằm nâng cao tính chống chịu bất lợi ở cây lạc.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR