ĐÁNH GIÁ HOẠT TÍNH IN SILICO CỦA MỘT SỐ CÁC HỢP CHẤT XANTHONE TỪ SINH VẬT BIỂN NHƯ CÁC CHẤT ỨC CHẾ PI3Kγ BẰNG PHƯƠNG PHÁP GẮN KẾT PHÂN TỬ

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thị Thực Bùi, Hồng Lê Cao, Đình Khải Đậu, Thị Thùy Linh Đinh, Thị Nguyên Mạc, Lan Hương Nguyễn, Ngọc Thụy Nguyễn, Trung Đức Nguyễn, Thị Thùy Nhung Trương

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên, 2024

Mô tả vật lý: tr.220 - 227

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 380128

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Protein PI3Kγ is a well-defined kinase target for cancer treatment that is important in regulating cell signaling, metabolism, growth, and cell proliferation. Our research aims to assess the anti-proliferation activity and mechanisms, the dual PI3K/mTOR binding affinity, and the mechanism of action of a series of bioactive xanthone derivatives from the marine. The performance of the AutoDock Vina software for predicting ligand-receptor binding affinities and poses of the compounds under study was first verified by available experimental data. Based on the validated AutoDock Vina parameters, a database of 169 marine xanthones were screened against the protein PI3Kγ. Natural compounds with lower docking scores (ΔG = -9,12 kcal/mol) than the positive control were subjected to MD simulation to evaluate structural changes compliant with the protein PI3Kγ. Structure and energy analyses showed that Austocystin L is highly stable within the active sites of the protein PI3Kγ. Austocystin L and Neocitreamicins I were suggested as agents against the protein PI3Kγ and to direct further biochemical experiments based on in silico calculations.Protein PI3Kγ là một đích kinase được xác định rõ trong điều trị ung thư, đóng vai trò quan trọng trong việc điều chỉnh tín hiệu tế bào, chuyển hóa, sự phát triển và sự sinh sản của tế bào. Nghiên cứu của chúng tôi nhằm đánh giá khả năng ức chế với PI3Kγ, và cách thức tác động của một loạt các dẫn xuất xanthone có hoạt tính sinh học từ nguồn sinh vật biển. Hiệu quả của phần mềm AutoDock Vina để dự đoán ái lực liên kết giữa phối tử và thụ thể cũng như vị trí của các hợp chất nghiên cứu đã được xác minh trước đó thông qua dữ liệu thực nghiệm có sẵn. Dựa trên các tham số AutoDock Vina đã được xác minh, một cơ sở dữ liệu gồm 169 xanthone từ sinh vật biển đã được sàng lọc đối với protein PI3Kγ. Các hợp chất tự nhiên có ái lực liên kết thấp hơn (ΔG = -9,12 kcal/mol) so với chất đối chứng dương đã được phân tích để đánh giá sự tương tác giữa các hợp chất nghiên cứu với protein PI3Kγ. Phân tích cấu trúc và năng lượng cho thấy rằng Austocystin L rất ổn định trong các vị trí hoạt động của protein PI3Kγ. Austocystin L và Neocitreamicins I được đề xuất làm tác nhân chống lại protein PI3Kγ và để định hướng thêm cho các thực nghiệm sinh hóa dựa trên tính toán in silico.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR