Tự chủ trong giáo dục đại học đang là xu hướng và là trọng tâm trong công cuộc đổi mới giáo dục đại học hiện nay. Trong quá trình hơn 30 năm thực hiện tự chủ trong giáo dục đại học, các trường đại học đã phải đối mặt với rất nhiều khó khăn, vướng mắc, thậm chí là rào cản. Trên cơ sở nghiên cứu và phân tích những khó khăn, vướng mắc trong việc thực hiện và phát triển quyền tự chủ ở các trường đại học, tác giả đã đưa ra một số khuyến nghị điện tử có thể áp dụng cho cơ chế tự chủ trong giáo dục đại học của Việt Nam.