Những vấn đề phải chứng minh trong vụ án hình sự là hệ thống các tình tiết phản ánh sự thật khách quan cần phải được làm rõ để giải quyết vụ án hình sự theo đúng quy định của pháp luật. Trong điều tra vụ án vi phạm quy định về bảo vệ động vật nguy cấp, quý, hiếm, để làm rõ sự thật vụ án thì cơ quan điều tra cần chứng minh có hành vi phạm tội xảy ra hay không, thời gian, địa điểm và những tình tiết khác của hành vi phạm tội
xác định chủ thể thực hiện hành vi phạm tội
mức độ chịu trách nhiệm hình sự, mức hình phạt và những tình tiết khác có ý nghĩa đối với việc giải quyết vụ án.