Đảng bộ Trường Đại học Cần Thơ được hình thành cùng với quá trình tiếp quản Trường Đại học Cần Thơ sau ngày giải phóng miền Nam, thống nhất đất nước
Chi bộ Đảng đầu tiên được thành lập tháng 5-1975. Quá trình xây dựng và trưởng thành, dưới sự lãnh đạo của tổ chức Đảng, đặc biệt trong giai đoạn hiện nay, dưới sự lãnh đạo của Đảng ủy, Trường Đại học cần Thơ ngày càng phát triển, xứng đáng là cơ sở đào tạo đại học và sau đại học trọng điểm ở đồng bằng sông Cửu Long. Đến đầu năm 2021, Đảng bộ có 1.626 đảng viên, với 36 Đảng bộ và chi bộ trực thuộc. Với số lượng cán bộ, đảng viên và sinh viên rất lớn, việc tuyên truyền, triển khai thực hiện Chỉ thị số 05-CT/TW của Bộ Chính trị về "
Đẩy mạnh học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh"
, là một trong những công tác được Đảng ủy Trường quan tâm sâu sắc, qua chỉ đạo thực hiện đã đạt được những kết quả quan trọng.