Trong quá trình thực hiện các dự án thủy lợi, có nhiều dự án phải đối mặt với vấn đề vượt chi phí đầu tư xây dựng trong giai đoạn thi công, có nhiều nguyên nhân ảnh hưởng cả khách quan lẫn chủ quan. Nghiên cứu này tìm ra các nhóm nhân tố ảnh hưởng đến chi phí đầu tư xây dựng trong giai đoạn thi công các công trình thủy lợi, sử dụng phân tích Crobach Alpha và phân tích nhân tố khám phá EFA để tìm ra các nhóm nhân tố chính ảnh hưởng đến sự biến động chi phí. Kết quả chỉ ra rằng có 7 nhóm nhân tố ảnh hưởng đến chi phí trong giai đoạn thi công xây dựng các công trình thủy lợi, trong đó nhóm nhân tố năng lực nhà thầu thi công, nhóm nhân tố chính sách và nhóm nhân tố kinh tế có ảnh hưởng rất lớn nhất đến sự biến động về chi phí đầu tư trong giai đoạn thi công các công trình thủy lợi ở Việt Nam.