Nghiên cứu này nhằm đánh giá đa dạng di truyền và sai khác di truyền của gà Lạc Sơn với một số giống gà khác thông qua sử dụng 20 chỉ thị microsatellites. Kết quả chỉ ra rằng các locus sử dụng trong nghiên cứu này là đa hình và phong phú về alen với trung bình số alen trên một locus là 6,73. Gà Lạc Sơn có tính đa dạng di truyền ở mức trung bình với dị hợp tử lý thuyết là 0,60, số alen trung bình là 6,05 alen/locus
hệ số cận huyết rất thấp. Khoảng cách di truyền giữa gà Lạc Sơn với gà Tai đỏ là lớn nhất và với gà Đông Tảo là nhỏ nhất và có phân bố riêng một nhánh trong cây quan hệ phát sinh loài. Sự khác biệt về di truyền giữa các quần thể phụ thuộc vào khoảng cách địa lý. Ba giống gà Ri, Đông Tảo và Mía ở vùng đồng bằng sông Hồng được xếp chung vào một nhóm. Giống gà Lạc Sơn ở vùng Bắc Trung Bộ tách thành một nhánh riêng và khác biệt với gà rừng Tai đỏ.