Đổi mới cơ chế quản lý theo hướng trao quyền tự chủ, tự chịu trách nhiệm cho các đơn vị giáo dục đại học công lập là phù hợp với chủ trương, đường lối mở cửa, hội nhập của Đảng và Nhà nước ta. Thời gian qua, việc thực hiện cơ chế tự chủ tại các trường đại học công lập ở Việt Nam đã được triển khai thí điểm và có những kết quả ban đầu. Tuy nhiên, để phát huy cơ chế này một cách có hiệu quả, cần phải tiếp tục đổi mới mạnh mẽ bằng những giải pháp thiết thực hơn nữa. Bài viết làm rõ đặc thù của quản lý đầu tư công tại các trường đại học công lập tự chủ, đánh giá những kết quả tích cực, chỉ ra những hạn chế và nguyên nhân để từ đó đưa ra các giải pháp hoàn thiện công tác quản lý đầu tư công tại các trường đại học công lập tự chủ trong thời gian tới., Tóm tắt tiếng anh, Renovating the management mechanism in the direction of giving autonomy and self-responsibility to public higher education institutions is in line with the policy of the Party and the State on international integration. Over the past years, the autonomy mechanism has been piloted at public universities in Vietnam with certain initial achievements. However, in order to effectively promote this mechanism, it is essential to have more practical solutions. This paper focuses on clarifying the characteristics of public investment management at autonomous public universities, assessing the positive effects, pointing out the limitations and causes, there by proposing feasible solutions to improve public investment management at autonomous public universities in the future.