Nghiên cứu này được thực hiện để đánh giá sự đa dạng di truyền trên 30 giống lúa địa phương được cung cấp bởi Viện Nghiên cứu Phát triển đồng bằng sông Cửu Long bằng việc sử dụng 25 cặp mồi SSR Kết quả cho thấy trong tổng số 25 cặp mỏi SSR, có 22 cặp mỗi có tính đa hình (88%). Các cặp mồi SSR phát hiện tổng số 62 bảng đa hinh trong tổng số 70 bằng được khuếch đại. Hệ số đa dạng di truyền (PIC) trên các locus dao động trong khoảng từ 0,0605 đến 0,7010. Dựa vào phương pháp UPGMA có thể phân nhóm 30 giống lúa địa phương thành 3 nhóm chính. Mức tương đồng di truyền của chúng dao động từ 56% đến 94%. Những dữ liệu trong nghiên cứu này góp phần cung cấp thông tin di truyền làm cơ sở cho lai tạo giống trong tương lai.