Trong hệ thống chương trình giáo dục - đào tạo ở trường Đại học Nguyễn Huệ, các môn khoa học Mác - Lênin, tư tưởng Hồ Chí Minh có vai trò rất quan trọng. Nó không chỉ trang bị cho người học những kiến thức cơ bản về chủ nghĩa Mác - Lênin, tư tưởng Hồ Chí Minh, đường lối, quan điểm của Đảng Cộng sản Việt Nam mà còn góp phần hình thành thế giới quan, phương pháp luận khoa học, định hướng phấn đấu theo mục tiêu, lý tưởng của Đảng, xây dựng niềm tin, nâng cao ý thức trách nhiệm của người học trước những nhiệm vụ trọng đại của đất nước và những vấn đề thực tiễn đặt ra. Tuy nhiên vẫn còn một số bất cập, hạn chế so với mục tiêu, yêu cầu đào tạo đòi hỏi người giảng viên phải thực hiện đồng bộ nhiều giải pháp nâng cao hơn nữa chất lượng giảng dạy, đáp ứng yêu cầu, nhiệm vụ trong tình hình mới.