Chính phủ đã ban hành nhiều chính sách nhằm từng bước đổi mới cơ chế hoạt động của các cơ quan hành chính nhà nước (HCNN). Tuy nhiên, cơ chế quản lý tài chính đối với các cơ quan này hiện vẫn còn nhiều bất cập, nhất là trong công tác quản lý tài chính. Trong bối cảnh đó, yêu cầu về hoàn thiện công tác quản lý tài chính hiệu quả tại các cơ quan HCNN là cần thiết. Bài viết nêu những thành tựu và hạn chế còn tồn tại trong công tác quản lý tài chính tại cơ quan HCNN, từ đó đưa ra giải pháp khắc phục những hạn chế này nhằm thực hiện quá trình tự chủ tài chính có hiệu quả hơn., Tóm tắt tiếng anh, The government has issued many policies to gradually improve and innovate the operating mechanism of state administrative agencies. However, the financial management mechanism for state administrative agencies still has many shortcomings. It is essential for state administrative agencies to enhance their financial management efficiency. This paper points out the achievements and shortcomings in the financial management mechanism of state administrative agencies. Based on the papers findings, some solutions are proposed to help these agencies overcome their financial management shortcomings and better implement the financial autonomy mechanism.