Phương pháp xử lý các động vật có hiệu quả phải ngăn được sự truyền bệnh và không gây ô nhiễm nguồn nước uống, đất và không khí. Đẻ đảm bảo xử lý đạt hiệu quả, tránh lây lan phát tán mầm bệnh và giảm thiểu các tác động xấu tới môi trường, FAO đã đưa ra các khuyến cáo và hướng dẫn cho việc xử lý xác động vật khi có dịch bệnh xảy ra như lở mồm long móng, cúm gia cầm, dịch tả lợn Châu Phi.. và các bệnh truyền lây giữa động vật và người.