Phân tích sự phức tạp về phân loại của các loài tảo thuộc nhánh Chlorella (Chlorellaceae)

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Xuân Cường Mai, Minh Lý Nguyễn, Bá Duy Võ

Ngôn ngữ: Vie

Ký hiệu phân loại: 592 Invertebrates

Thông tin xuất bản: Khoa học và công nghệ Việt Nam , 2023

Mô tả vật lý: 45579

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 409177

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Tóm tắt
Chủ đề

Trong nghiên cứu này, 253 trình tự vùng gen 18S rDNA, 155 trình tự vùng gen ITS2, 63 trình tự đoạn gen rbcL và 23 trình tự đoạn gen tufA được thu thập trên GenBank để đánh giá và phân tích mức độ phức tạp về phân loại của nhánh Chlorella. Kết quả phân tích các cây phát sinh loài cho thấy, C. vulgaris và C. sorokiniana với số lượng trình tự mã vạch DNA trên GenBank lớn có thể được chia thành 2-3 nhóm nhỏ với sự khác biệt về mặt di truyền. Ngoài ra, nghiên cứu cũng đã nhận thấy các trình tự của các loài cùng chi hoặc khác chi phân bố trong một nhóm phân loại trên cây phát sinh loài. Ví dụ, Actinastrum hantzschii, C. chlorelloides, C. singularis, C. sorokiniana, C. thermophila, C. volutis, C. vulgaris, Micractinium pusillum và M. reisseri cùng thuộc một nhóm trên cây phát sinh loài 18S rDNA. Điều đó cho thấy sự phức tạp trong phân loại nhánh Chlorella không những đến từ các loài khó xác định mà còn trong mối quan hệ di truyền của các loài còn lại. Như vậy, việc định danh và xác định mối quan hệ của các loài thuộc nhánh Chlorella còn gặp nhiều khó khăn, gây ra bởi sự phức tạp về cơ sở dữ liệu trên GenBank cũng như hệ thống phân loại chưa được hoàn thiện. Việc làm rõ mối quan hệ di truyền là cần thiết nhằm mục đích cải thiện hệ thống phân loại và định danh các chủng phân lập mới thuộc nhánh Chlorella., Tóm tắt tiếng anh, In this study, 253 of 18S rDNA sequences, 155 of ITS2 sequences, 63 of rbcL sequences, and 23 of tufA sequences were collected on GenBank to evaluate and analyse the taxonomic complexity of the Chlorella clade. C. vulgaris and C. sorokiniana had the most collected sequences of DNA barcoding. Analysis of phylogenetic tree results showed that the strains of these two species were divided into 2 to 3 small groups with genetic differences. In addition, different species belonging to the same clade in phylogenetic trees were observed. For example, Actinastrum hantzschii, C. chlorelloides, C. singularis, C. sorokiniana, C. thermophila, C. volutis, C. vulgaris, Micractinium pusillum, and M. reisseri belonged to the same group of the 18S rDNA phylogenetic tree. This showed the complexity in the taxonomy of the Chlorella clade came not only from the cryptic species, but also from the genetic relationships of the remaining species. Therefore, identifying and determining the relationship of Chlorella clade species have been still challenging, because of the complexity of the database on GenBank as well as the incomplete taxonomic system. Clarification of the genetic relationship is needed to improve the taxonomy and identification of new isolates of the Chlorella clade.

Tạo bộ sưu tập với mã QR