Trong quá trình ủ compost, các chất thải rắn có nguồn gốc sinh học sẽ bị phân hủy bởi các vi sinh vật, tạo ra carbon dioxide, nước, nhiệt và các chất mùn (compost). Trong các vi sinh vật, nhóm vi nấm có vai trò quan trọng trong việc phân giải các hợp chất bền vững như cellulose, lignin và các vật liệu khác. Gần đây, tại một số địa phương như tỉnh Bình Dương, rác thải đô thị đã được xử dụng như vật liệu đầu vào của quá trình ủ compost ở quy mô lớn. Để có thể kiểm soát hợp lý và tối ưu hóa quá trình ủ compost, mà bản chất là hoạt động phân hủy của vi sinh vật, thì các hiểu biết về các vi sinh vật tham gia vào quá trình này là thật sự cần thiết. Do đó, mục tiêu của nghiên cứu này là phân lập và xác định các nhóm vi nấm tham gia vào quá trình ủ compost chất thải rắn sinh học đô thị tại Việt Nam. Chúng tôi đã quan sát thấy có 10 chủng vi nấm có sự khác biệt về hình thái hiện diện trong quá trình ủ compost, các chủng vi nấm này sau đó được định danh dựa trên các phân tích chi tiết về hình thái và trình tự 18S rDNA của chúng. Kết quả thí nghiệm cho thấy các chủng vi nấm chiếm ưu thế thuộc về bốn chi khác nhau bao gồm Aspergillus, Penicillium, Monascus và Trichoderma. Các quan sát của chúng tôi có sự tương đồng lớn với những nghiên cứu khác trên thế giới về nhóm vi nấm ưu thế trong quá trình ủ compost là chi Aspergillus và Penicillium do khả năng chịu nhiệt và phân hủy nhiều loại vật chất hữu cơ khác nhau. Bên cạnh đó, hai chi Trichoderma và Monascus, đã được ghi nhận khả năng bẻ gãy các vật chất khó phân hủy giàu lignin. Các kết quả này sẽ là dữ liệu tham khảo hữu ích cho các phân tích sâu hơn về sự đa dạng và chức năng của các vi nấm trong quá trình phân hủy chất thải rắn sinh học đô thị ở Việt Nam.