Mô hình hóa tương đồng và ứng dụng trong thiết kế thuốc

 0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Lê Anh Vuux, Nguyễn Thúy Hương, Phan Thị Cẩm Quyên

Ngôn ngữ: Vie

Ký hiệu phân loại: 615 Pharmacology and therapeutics

Thông tin xuất bản: Khoa học và Công nghệ - Đại học Thái Nguyên, 2019

Mô tả vật lý: 173-184

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 414026

Trong nhiều thập kỷ qua, mô hình hóa tương đồng đã trở thành công cụ phổ biến để mô hình hóa cấu trúc ba chiều (3D) giả thuyết của các protein quan tâm. Mục đích của quá trình này là để tạo ra cấu trúc 3D của các protein mà cấu trúc vẫn chưa được xác định bằng các phương pháp thực nghiệm. Cơ sở cho mô hình hóa tương đồng dựa trên sự quan sát rằng các homolog protein với chuỗi acid amin tương tự sẽ có cấu trúc 3D giống nhau. Mô hình hóa tương đồng sử dụng các phương pháp dựa trên máy tính (in silico) để tạo ra các mô hình cấu trúc 3D cho protein mục tiêu dựa trên một protein khuôn mẫu. Cách gấp cuộn của mô hình được tạo ra dựa trên sự tương ứng giữa mô-típ cấu trúc của protein khuôn mẫu và mục tiêu. Mô hình hóa tương đồng hiện đang là phương pháp đáng tin cậy nhất bên cạnh các phương pháp thực nghiệm để tạo ra mô hình chất lượng cho nhiều ứng dụng khác nhau trong thiết kế thuốc. Cho đến nay, mô hình hóa tương đồng đã được sử dụng thành công trong xác định phân tử khởi nguồn bằng docking phân tử, để đề xuất cơ chế tương tác giữa thụ thể - phối tử, để tạo điều kiện cho các thí nghiệm gây đột biến và để làm cơ sở cho tối ưu hóa các phối tử tiềm năng. Trong bài tổng quan này, chúng tôi báo cáo những phát triển hiện tại trong lĩnh vực này, thảo luận về những hạn chế của mô hình hóa tương đồng và giới thiệu các ứng dụng mới nhất của kỹ thuật này vào quy trình thiết kế thuốc hiện đại., Tóm tắt tiếng anh, In the last decades, homology modeling has become a popular tool to build hypothetical threedimensional (3D) structures of interested proteins. The aim of this process is to model 3D structure of proteins that have not been structured from experimental methods. The basis for homology modeling is based on the observation that homolog proteins with similar amino acid sequences will have the same 3D structure. Homology modeling uses computer-based methods (in silico) to create 3D structures of target protein based on a template protein. The folding pattern of the model is created based on the correspondence between the structural motif of template and target proteins. Homology modeling is currently the most reliable method besides experimental methods to create quality models for many different applications in drug design. Homology modeling so far has been successfully used to identify lead molecule by molecular docking, to propose ligandreceptor interactions, to facilitate mutagenesis experiments, and to guide optimization of potential ligands. In this review, we report current developments in this area, discuss the limitations of homology modeling, and address the latest applications of this technique to the mordern drug design
Tạo bộ sưu tập với mã QR

THƯ VIỆN - TRƯỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHỆ TP.HCM

ĐT: (028) 71010608 | Email: tt.thuvien@hutech.edu.vn

Copyright @2024 THƯ VIỆN HUTECH