Tại Khu Bảo tổn Thiên nhiên Bắc Hướng Hóa, tỉnh Quảng Trị có 13 loài thuộc 8 chi, 5 họ được ghi nhận thuộc ngành thực vật hạt trần - Gymnosperm, trong đó họ Gắm - Gnetaceae có 5 loài, họ Kim giao Podocarpaceae có 4 loài, họ Tuế - Cycadaceae có 2 loài, họ Thông - Pinaceae có 1 loài và họ Đinh tùng - Cephalotaxaceae có 1 loài. Các loài thực vật quý, hiếm thuộc ngành hạt trần có giá trị cần bảo tồn có tới 12 loài trong Danh lục Đỏ thế giới IUCN (2019), 3 loài trong Sách Đỏ Việt Nam (2007) và 1 loài theo Nghị định 06/2014/NĐ-CP. Đã cung cấp thông tin về đặc điểm phân bổ và hiện trạng quần thể của các loài thực vật hạt trấn là thân cột và thán go đứng tại khu vực nghiên cứu. Các loài hạt tran chủ yếu gặp ở độ cao từ 800 m trở lên. Có 4 loài gặp rải rác là Đinh tùng - Cephalotaxus manii Hook. f., Thông tre lá dài - Podocarpus neriifolius D. Don, Kim giao núi đất - Nageia wallichiana (C. Presl.) O. Kuntze và Hoàng đàn giả - Dacrydium elatum (Roxb.) Wall. ex Hook.
1 loài hiếm gặp là Thông lông gà - Dacrycarpus imbricatus (Blume) de Laub.
3 loài rất hiếm gặp là Thiên tuế gân chim Cycas immersa Craib., Tuế lược (Cycas pectinata Buch-Ham.), Du sam núi đất (Keteleeria evelyniana Mast.).