Nghiên cứu tập trung sàng lọc vi khuẩn xử lí ammonium từ các mẫu bùn thải trong chăn nuôi. Mẫu được thu tại các khu vực thuộc TP. Hồ Chí Minh, Tiền Giang và Bến Tre. Nhóm vi khuẩn có khả năng xử lý ammonium phân lập từ nguồn bùn thải chăn nuôi heo, bùn ao cá tra, bùn ao tôm dao động lần lượt trong khoảng (1,5 2,4) x 10 MPN/g
(0,15 - 1,5) x 10 MPN/g và (0,93 - 2,4) x 10 MPN/g. Dựa vào đặc điểm hình thái và sinh hóa, đã tuyển chọn được 6 chủng vi khuẩn có đặc điểm giống ParacoCcus và 3 chủng giống Nitrosomonas. Bốn chủng có hoạt tính xử lý ammonium cao nhất (120,83- 123,66 mg/L) sau khi nuôi cấy trong 168 h được chọn để thực hiện giải trình tự 16S rRNA Kết quả giải trình tự và so sánh với dữ liệu trên ngân hàng gen (GenBank) cho thấy 02 chủng S4 và S6 tương đồng với Paracoccus communis (99%). chủng S9 tương đồng với Paracoccus versutus (100%), chủng S3 tương đồng với Nitrosomonas europaea (100%). Hai chủng S4 và S6 thuộc loài Paracoccus communis đã cho thấy khả năng xử h ammonium lên đến 74,9% và 76,65%. Đây là lần đầu tiên Paracoccus communis được phân lập từ bùn thải và được báo cáo là vi khuẩn có khả năng xử lí amonium.