Là cơ quan quản lý nhà nước đa ngành, đa lĩnh vực, lại có số lượng cán bộ, công chức phải thường xuyên tiếp xúc trực tiếp với người dân và DN rất lớn, vì vậy công tác phòng chống tham nhũng (PCTN), lãng phí luôn được Bộ Tài chính chú trọng, coi là nhiệm vụ thường xuyên, liên tục.