Kế toán quản trị có vai trò quan trọng trong việc cung cấp thông tin phục vụ quản trị nội bộ cho các nhà quản lý không chỉ trong doanh nghiệp, mà còn ở cho các đơn vị hành chính sự nghiệp như bệnh viện. Bằng phương pháp nghiên cứu định tính, kết hợp với định lượng, mục đích của nghiên cứu này là xác định mức độ tác động của các nhân tố đến việc vận dụng kế toán quản trị trong các bệnh viện công tuyến quận tự chủ tài chính, nhằm tìm ra câu trả lời cho những thách thức của việc tổ chức kế toán quản trị tại các đơn vị hành chính sự nghiệp nói chung và cho các bệnh viện nói riêng khi tự chủ tài chính, từ đó đề xuất những hàm ý chính sách nhằm có thể vận dụng hiệu quả kế toán quản trị vào các đơn vị.