Quản lý tổng hợp tài nguyên, bảo vệ môi trường biển và hải đảo là phương thức quản lý được hoạch định và tổ chức thực hiện các chính sách, cơ chế, công cụ điều phối liên ngành, liên vùng
khắc phục các xung đột, mâu thuẫn trong quản lý ngành
sử dụng hợp lý, hiệu quả và bảo vệ tài nguyên, môi trường và các hệ sinh thái biển, thống nhất các hoạt động quản lý từ trung ương đến địa phương, đảm bảo phát triển bền vững biển và hải đảo. Hiện nay, pháp luật có quy định về sự tham gia của cộng đồng dân cư
tổ chức, cá nhân có liên quan trong quản lý tổng hợp tài nguyên, bảo vệ môi trường biển và hải đảo. Tuy nhiên, những quy định còn chưa cụ thể nên chưa tạo thành cơ chế để bảo đảm cho sự tham gia của cộng đồng dân cư, tổ chức, cá nhân có liên quan. Do đó, đòi hỏi các cơ quan chức năng cần sớm hoàn thiện cơ chế trong quản lý tổng hợp tài nguyên, bảo vệ tài nguyên, môi trường biển và hải đảo.