Chính sách hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) đầu vào của dự án đầu tư có ỷ nghĩa quan trọng giúp doanh nghiệp giảm bớt khó khăn về tài chỉnh trong giai đoạn đầu tư, cải thiện dòng tiền, khuyến khích tái đầu tư, mở rộng sản xuất, kỉnh doanh. Luật thuế GTGT và các văn bản hướng dẫn quy định chỉ tiết về các trường hợp được hoàn thuế GTGT dự án đầu tư và điều kiện hoàn thuế. Tuy nhiên, việc áp dụng các quy định về hoàn thuế GTGT dự án đầu tư trong thực tế phát sinh nhiều bất cập, chưa đồng bộ giữa Luật thuế GTGT, nghị định và thông tư hướng dẫn, cũng như điều kiện hoàn thuế chưa phù hợp thực tiễn. Bài viết phân tích một so vướng mắc, bất cập trong quy định về hoàn thuế GTGT đầu vào của dự án đầu tư. Từ đó, đưa ra một sổ kiến nghị nhằm hoàn thiện hơn nữa quy định về hoàn thuế GTGT dự án đầu tư trong thời gian tới.