Nghiên cứu này hướng đến việc đo lường thực trạng của việc tổ chức và thực hiện kiểm soát nội bộ (KSNB), trong các đơn vị sự nghiệp công lập (ĐVSNCL) trực thuộc Sở Giao thông vận tải (SGTVT) tỉnh Bình Dương đang thực hiện tự chủ tài chính (TCTC). Bên cạnh đó, nghiên cứu còn xem xét việc hoàn thiện tổ chức và thực hiện KSNB trên thực tế có đáp ứng được yêu cầu TCTC tại các đơn vị hay không? Kết quả nghiên cứu cho thấy, các ĐVSNCL trực thuộc SGTVT thực sự chú trọng vai trò của KSNB và nâng cao mức độ thực hiện của KSNB khi thực hiện TCTC. Tuy nhiên, việc gia tăng mức độ thực hiện KSNB không đồng đều giữa các nhóm TCTC.