Xây dựng đường chuẩn phục vụ định lượng tỷ lệ methyl hóa LINE-1 trên các hệ thống máy real-time PCR

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thị Thân Nguyễn, Thế Tùng Phạm, Thị Quỳnh Trang Trần, Thị Thương Lan Võ

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Khoa học Y dược - Đại học Quốc gia Hà Nội, 2023

Mô tả vật lý: 65 - 73

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 435070

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Tóm tắt
Chủ đề

Real-time PCR là kĩ thuật phổ biến trong chẩn đoán sinh học phân tử, được sử dụng trên nhiều hệ thống máy real-time khác nhau. Mỗi hệ thống có sự khác biệt về bộ phận gia nhiệt, nguồn sáng kích thích, hệ thống phát hiện huỳnh quang và phần mềm phân tích số liệu. Vì thế khi sử dụng các hệ thống máy khác nhau có thể ảnh hưởng đến giới hạn phát hiện của mẫu sinh phẩm. Nghiên cứu của chúng tôi nhằm tối ưu hóa ngưỡng threshold để đảm bảo các thông số hiệu suất phản ứng (E) và hệ số tuyến tính (R2) của đường chuẩn sử dụng để định lượng methyl hóa LINE-1 trên ba hệ thống real-time PCR Applied Biosystems™ 7500, QuantStudio™5 Dx và abCyclerQ (AIT Biotech). Chúng tôi đã xác định ngưỡng threshold thích hợp để xây dựng đường chuẩn đảm bảo hệ số tuyến tính R2và hiệu suất khuếch đại E tương đồng nhau trên ba hệ thống máy (R2>
0,999, E ≥ 95%). Áp dụng các thông số tối ưu cho ba hệ thống Applied Biosystems™ 7500, QuantStudio™5 Dx, abCyclerQ (AIT Biotech) cho phép xác định tỷ lệ methyl hoá yếu tố vận động LINE-1 ở 50 mẫu DNA tự do trong máu ngoại vi của bệnh nhân ung thư phổi đều có giá trị như nhau, chứng tỏ cả ba hệ thống máy đều có thể sử dụng thay thế lẫn nhau trong phân tích methyl hóa LINE-1.

Tạo bộ sưu tập với mã QR