Khám phá mối quan hệ phát sinh loài giữa các đơn vị phân loại cung cấp thông tin quan trọng cho khoa học. Nghiên cứu phát sinh loài của chi Macrosolen được thực hiện dựa trên bộ dữ liệu phân tử của 27 mẫu nghiên cứu với năm vùng DNA bao gồm các gen lục lạp rbcL, matK, và trnL-F và gen nhân (SSU rDNA và LSU rDNA). Các phương pháp Maximum likelihood (ML) và Bayesian inference (BI) được sử dụng để xây dựng cây phát sinh loài. Các kết quả phân tích dữ liệu phân tử ủng hộ mạnh mẽ rằng Macrosolen không phải là đơn phát sinh với hai nhánh phát sinh chính trong chi này. Sự đan xen vào nhau của ba chi Elytranthe, Lepidaria và Macrosolen trên cây phát sinh được ghi nhận là tương đồng với dữ liệu hình thái, phân tử và sự phân bố của chúng, tuy nhiên cần nghiên cứu thêm để giải quyết rõ ràng các ranh giới cho một sắp xếp phân loại chắc chắn cho ba chi. Loài đặc hữu M. bidoupensis của Việt Nam có quan hệ di truyền gần gũi với M. tricolor dựa trên dữ liệu phân tử. Nhìn chung, các mẫu Macrosolen ở Việt Nam có sự tương đồng di truyền với các mẫu của chi này từ các nước khác.