Xây dựng quy trình chẩn đoán East Asian Passiflora virus gây bệnh trên chanh dây (Passiflora edulis Sims) bằng real-time PCR

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Nguyễn Minh Nghĩa Huỳnh, Đăng Quân Nguyễn, Xuân Dũng Nguyễn

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Khoa học và Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam, 2021

Mô tả vật lý: 85 - 93

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 445834

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

East Asian Passiflora virus (EAPV) là một trong ba loại virus gây bệnh hóa bần vỏ trái ảnh hưởng nghiêm trọng đến năng suất và chất lượng chanh dây. Để kiểm soát hiệu quả bệnh này cần phát hiện sớm và chính xác sự hiện diện của virus trên cây. Nghiên cứu này thiết lập quy trình phản ứng chuỗi polymerase thời gian thực (real-time polymerase chain reaction, RT-PCR) phát hiện virus từ mô lá chanh dây nhiễm bệnh. Phân đoạn gen mã hóa protein vỏ của virus được khuếch đại bằng phản ứng RT-PCR, tách dòng và kiểm chứng bằng phân tích trình tự trước khi thiết lập phản ứng RT-PCR. Ngưỡng phát hiện (LOD) và giới hạn định lượng (LOQ) của phản ứng khuếch đại cũng được xác định. Kết quả cho thấy phản ứng RT-PCR đã khuếch đại được phân đoạn gen (188 bp) tương đồng trên mức 90% so với các trình tự gen đã công bố của virus EAPV. Phản ứng RT-PCRcó phương trình đường chuẩn dạng y = -3,3346x + 40,924 với hệ số tương quan R2= 0,9903. Ngưỡng phát hiện và giới hạn định lượng của phản ứng đạt mức tương ứng 100 và 1.000 bản sao/µL. Các mẫu chanh dây thu thập bị nhiễm virus với số lượng dao động từ 105đến 107copies/µL.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR