Phân tích đa dạng di truyền nhóm Bacillus subtilis bằng phương pháp giải trình tự đoạn protein ngón tay kẽm (Zinc finger protein) và kỹ thuật PCR dùng mồi thiết kế trên các chuỗi lặp (rep-PCR)

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thị Thanh Tịnh Bùi, Lưu Phương Hạnh Lê, Văn Hậu Lê, Huỳnh Phương Thảo Ngô, Đăng Quân Nguyễn, Hoàng Chi Mai Nguyễn, Ngọc Phương Linh Trần

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại: 576.5 Genetics

Thông tin xuất bản: Tạp chí Khoa học và Công nghệ Nông nghiệp Việt Nam, 2021

Mô tả vật lý: 28 - 33

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 446380

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Tóm tắt
Chủ đề

Đa dạng di truyền của 49 chủng thuộc nhóm Bacillus subtilis phân lập ở An Giang và Cần Thơ được khảo sát bằng phương pháp giải trình tự đoạn gen Zinc finger và phương pháp PCR dùng mồi thiết kế trên các chuỗi lặp (Repetitive element sequence-based PCR, rep-PCR). Cây phát sinh loài dựa trên trình tự đoạn gen Zinc finger cho thấy 49 chủng thuộc nhóm B. subilis được chia thành 02 nhóm chính (I và II) và tương đồng cao với các loài B. velezensis và B. amyloliquefaciens, B. siamensis, B. subtilis, B. tequilensis. Riêng chủng B1008 hoàn toàn tách biệt với các chủng khác và chỉ tương đồng 91,7% với chủng B. velezensis WLYS23. Trong khi đó, cây phân nhóm dựa trên rep-PCR với mồi BOX-A1R cho thấy 49 chủng này được chia làm 2 nhóm chính (A và B). Nhóm A phân thành các nhóm phụ (A1, A2) có kết quả giải trình tự tương đồng với các loài B. velezensis và B. amyloliquefaciens, B. siamensis, B. subtilis. Nhóm B (gồm 4 chủng) có kết quả giải trình tự thuộc 4 loài khác nhau và chủng B1008 nằm tách biệt với các chủng khác. Từ những kết quả trên cho thấy, phương pháp giải trình tự đoạn gen Zinc finger và phương pháp rep-PCR có sự tương đồng trong việc phân nhóm các chủng thuộc nhóm B. subtilis. Đây là những công cụ hữu ích để đánh giá mối quan hệ di truyền cũng như góp phần định danh các chủng Bacillus spp.

Tạo bộ sưu tập với mã QR