Phát hiện đa hình nucleotide đơn (SNPS) ở dòng vi rút Sars-Cov-2 ở Việt Nam

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thi Thuy Duong Bui, Duc Anh Dang, Duy Khang Dinh, Van Quyen Dong, Quynh Mai Le, Van Truong Le, Thai Uy Nguyen, Thi Hoa Nguyen, Thi Lanh Pham, Xuan Thach Tran

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại: 660.6 Biotechnology

Thông tin xuất bản: Tạp chí Sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam, 2021

Mô tả vật lý: 95-105

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 447015

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Hội chứng hô hấp cấp tính nghiêm trọng coronavirus 2 (SARS-CoV-2) là tác nhân gây ra đại dịch bệnh hô hấp cấp tính ở người. Đại dịch này hiện đã lan rộng trên toàn thế giới và gây ra hơn 2.000.000 ca tử vong vào ngày 15 tháng 1 năm 2021. Sự phức tạp và đại dịch coronavirus SARS-CoV-2 đang diễn ra khiến việc kiểm soát dịch bệnh trở nên khó khăn. Phân tích trình tự trên một số khung đọc mở (ORF) của một chủng vi rút SARS-CoV-2 được phân lập tại Việt Nam vào tháng 2 năm 2020 (chủng SARS-CoV-2 / NIHE / người / 2020 / VIE) cho thấy một số đa hình đơn nucleotide (SNP) chỉ xuất hiện ở chủng Việt Nam so với chủng phân lập ở các nước khác, bao gồm: (1) sự thay đổi ORF8-Nucleocapsid (số gia nhập MT127114.1) ở nucleotide (nt) 691 (CTC trong SARS-CoV-2 / Chủng NIHE / người / 2020 / VIE, TTC trong tất cả các dòng phân lập khác) nhưng nó không thay đổi axit amin được mã hóa, (2) Vùng ORF3a-EM-ORF6-ORF7a (số gia nhập MT127115.1) có những thay đổi bốn điểm, ba trong đó dẫn đến những thay đổi trong trình tự axit amin, là nt 479 (Valine mã hóa GTA được thay đổi thành mã hóa TTA Leucine), nt 575 (Arginine mã hóa CGC thay đổi thành GGC mã hóa Glycine) trong gen M và nt 1126 (GTG mã hóa Valine đã thay đổi sang GAG mã hóa axit Glutamic) trong ORF6. Tổng hợp lại, các kết quả đã cung cấp thông tin hữu ích cho việc phát triển bộ dụng cụ chẩn đoán SARS-CoV-2 và vắc xin.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR