Ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS vào phân tích tự động dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen vi khuẩn

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Đức Nam Bùi, Hữu Thọ Hồ, Nhật Đức Hoàng, Thu Trang Hoàng, Phương Thảo Quyên Lê, Thị Ngọc Anh Nguyễn, Tiến Mạnh Trần, Trung Kiên Trần

Ngôn ngữ: vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Y dược lâm sàng 108, 2022

Mô tả vật lý: 159-163

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 449380

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Nghiên cứu kết quả bước đầu ứng dụng công cụ tin sinh AMROMICS trong phân tích tự động hệ gen của vi khuẩn kháng kháng sinh. Đối tượng và phương pháp: Phân tích toàn bộ hệ gen của 14 chủng vi khuẩn E. coli và chủng E. coli K-12 MG1655 được công bố trên cơ sở dữ liệu NCBI bằng công cụ tin sinh AMROMICS. Kết quả: Công cụ tự động phân tích toàn bộ hệ gen của 15 mẫu vi khuẩn trong thời gian ngắn, cùng lúc đưa ra kết quả về cấu trúc hệ gen, kiểu trình tự, gen độc lực, gen kháng với giao diện đơn giản và dễ sử dụng. Đa số các chủng nghiên cứu có thể là vi khuẩn đa kháng và mang gen kháng với các kháng sinh thông dụng như quinolone và aminoglycoside. Kết luận: Công cụ AMROMICS có tiềm năng ứng dụng trong lâm sàng để nhanh chóng xác định gen kháng kháng sinh và gen độc lực của vi khuẩn, trên cơ sở đó có thể ứng dụng trong điều trị và kiểm soát nhiễm khuẩn hiệu quả.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR