Trước yêu cầu mới của cải cách tư pháp và hội nhập quốc tế, Cơ quan điều tra Viện kiểm sát nhân dân tối cao cần đổi mới về tổ chức và nâng cao chất lượng hoạt động để trở thành công cụ sắc bén thực hiện chức năng, nhiệm vụ, tạo sự chuyển biến mang tính đột phá trong đấu tranh phòng, chống tội phạm tham nhũng, chức vụ xảy ra trong hoạt động tư pháp, bảo vệ công lý, bảo đảm sự minh bạch, liêm chính của hoạt động tư pháp, sự trong sạch của các cơ quan bảo vệ pháp luật.