Giám sát cúm gia cầm luôn là vấn đề cần được quan tâm đặc biệt vì dịch bệnh cúm A/H5 thường diễn biến rất phức tạp. Trong nghiên cứu này, chúng tôi đã tiến hành giám sát cúm A/H5 tại 4 chợ buôn bán gia cầm sống. Mẫu swab được thu thập từ gà và vịt với 5 mẫu swab được nhập lại thành 1 mẫu gộp. Mẫu được sử dụng để phân lập virus cúm A/H5 trên trứng gà đã có phôi và phân tích, phát hiện gen của cúm A bằng phương pháp Realtime RT-PCR. Mẫu dương tính với cúm type A được định type cho cúm H5 cũng bằng Realtime RT-PCR. Kết quả phân tích cho thấy trong 900 mẫu thu thập trong năm 2016, đã phân lập thành công 105 chủng virus, trong đó có tới 92 chủng được xác định là cúm type A với 34 mẫu có nguồn gốc từ gà và 58 mẫu có nguồn gốc từ vịt, trong đó 4 mẫu dương tính với H5 (3 mẫu H5N6 và 1 mẫu H5N1). Tất cả các mẫu dương tính với virus cúm H5 đều có nguồn gốc từ vịt tại các địa phương lân cận Hà Nội. Việc phân lập được virus cúm H5 tại chợ chứng tỏ việc buôn bán gia cầm sống là nguy cơ cho virus H5 xâm nhập vào Hà Nội, đồng thời cảnh báo khả năng virus H5 lây sang người. Việc phân lập được virus cúm type A nói chung và virus cúm H5 nói riêng tại các chợ nhấn mạnh việc tiếp tục giám sát và phân tích các chủng phân lập là cần thiết.