Phân tích bộ gen của vi khuẩn Aeromonas hydrophila được phân lập trong các trại nuôi cá tra sọc ở đồng bằng sông Cửu Long, Việt Nam

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Anh Hoang Hoang, Phi Nga Le, Le Hoai Nhan Nguyen, Thi Thanh Xuan Tran, Quang Vinh Tu

Ngôn ngữ: Vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: Tạp chí Sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam, 2021

Mô tả vật lý: 55-71

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 454289

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Tóm tắt
Chủ đề

Cá da trơn hay cá tra Việt Nam chủ yếu đóng góp vào xuất khẩu nuôi trồng thủy sản của cả nước. Tuy nhiên, các bệnh do vi khuẩn làm giảm hiệu quả sản xuất cá tra sọc dưa và bệnh phổ biến nhất là bệnh tụ huyết trùng do Aeromonas hydrophila gây ra. Vi khuẩn hoặc vi rút vi khuẩn đã được nghiên cứu như là tác nhân sinh học thay thế để kiểm soát các bệnh nhiễm trùng do vi khuẩn gây bệnh trong nuôi trồng thủy sản trong nhiều thập kỷ. Một số bộ gen của vi khuẩn A. hydrophila cá da trơn đã được phân tích, mặc dù nhiều bộ gen của vi khuẩn A. hydrophila ở các loài cá khác đã được nghiên cứu. Trong nghiên cứu này, toàn bộ trình tự bộ gen của ba thực khuẩn A. hydrophila mới như PVN03, PVN04 và PVN05 đã được mô tả. Phân tích hình thái bằng kính hiển vi điện tử truyền qua chỉ ra rằng những phage này thuộc họ Myoviridae. Kích thước bộ gen của các phage PVN03, PVN04 và PVN05 lần lượt là 50.725 bp, 51.721 bp và 51.884 bp. PVN03 có 64 khung đọc mở (ORF), trong khi PVN04 và PVN05 có 65 ORF và 66 ORF, tương ứng. Không có tRNA, rRNA hoặc sRNA, gen kháng thuốc kháng sinh, yếu tố độc lực, gen độc tố và gen tích hợp được phát hiện trong ba bộ gen của phage. Công cụ phân tích ANI cho thấy các phage Aeromonas hydrophila phân lập ở Việt Nam tạo thành một nhóm riêng biệt có độ tương đồng rất thấp với các phage Aeromonas hydrophila khác có trên cơ sở dữ liệu. Ngoài ra, phân tích cây phát sinh loài chỉ ra rằng những thể thực khuẩn này đã hình thành một chi mới trong họ Myrovidae.

Tạo bộ sưu tập với mã QR