Phú Yên là một tỉnh ven biển thuộc vùng Duyên hải miền Trung, có điều kiện tự nhiên thuận lợi để phát triển ngành thủy sản (nuôi trồng, khai thác, chế biến thủy sản). Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện ngành thủy sản của tỉnh đang gặp nhiều khó khăn, thách thức như biến đổi khí hậu, nước biển dâng, các hiểm họa của thiên tai
nguồn lợi thủy sản ngày càng suy giảm
rào cản kỹ thuật về chất lượng, vệ sinh, an toàn thực phẩm, môi trường,... yêu cầu ngày một cao. Vì vậy, phát triển ngành thủy sản bền vững ở tỉnh Phú Yên cần phải có các giải pháp phù hợp nhằm đảm bảo hài hòa vừa phát triển kinh tế, xã hội, vừa bảo vệ môi trường sinh thái, gắn với bảo vệ an ninh, chủ quyền biển đảo là vấn đề cần thiết trong giai đoạn hiện nay.