Hợp tác về y tế là một trong những lĩnh vực hợp tác văn hóa - xã hội quan trọng giữa Mỹ và ASEAN. Từ năm 2001 đến nay, Mỹ đã hỗ trợ ASEAN 3,5 tỷ USD cho các mục tiêu chung về một tưcmg lai khỏe mạnh, gồm phòng ngừa và điều trị HIV/AIDS
kiểm soát và chẩn đoản bệnh truyền nhiễm
cải thiện dinh dưỡng cho bà mẹ và trẻ em
mở rộng khả năng tiếp cận nước sạch. Những sáng kiến, dự án hợp tác đã giúp cứu người, bảo vệ người nhiễm bệnh và thúc đẩy sự ổn định cũng như sức khoẻ cộng đồng các quổc gia ASEAN và Mỹ, giúp hai bên đáp ứng tốt hơn mục tiêu y tế toàn cầu của thế kỷ XXI, cũng như giải quyết ngụy cơ an ninh phi truyền thong trong lĩnh vực y tế.