Xây dựng đối chứng chuẩn cho kĩ thuật qMSP xác định tỉ lệ methyl hóa promoter LINE-1

0 Người đánh giá. Xếp hạng trung bình 0

Tác giả: Thu Phương Lưu, Anh Thùy Dương Phạm, Thế Tùng Phạm, Thị Quỳnh Trang Trần, Thị Thương Lan Võ

Ngôn ngữ: Vie

Ký hiệu phân loại:

Thông tin xuất bản: VNU Journal of Science: Medical and Pharmaceutical Science, 2022

Mô tả vật lý: 65-73

Bộ sưu tập: Metadata

ID: 458114

Thêm vào giỏ Liên kết toàn văn

Sàng lọc sớm ung thư là một khía cạnh quan trọng của chăm sóc sức khỏe toàn diện, đóng góp một phần đáng kể trong việc làm giảm nguy cơ tử vong và chi phí điều trị cho người bệnh. Tìm ra các dấu ấn ung thư mới với độ nhạy và độ đặc hiệu cao đang là xu hướng trong hoạt động nghiên cứu ở Việt Nam cũng như trên thế giới. Các trình tự lặp phân bố trong hệ gen (Long interspersed element-1, LINE-1) là DNA lặp lại chiếm tỉ lệ lớn và có khả năng vận động đến các vị trí khác nhau trong hệ gen (genome). Sự vận động của LINE-1 được kiểm soát thông qua cơ chế methyl hóa DNA (phức CpG được gắn thêm nhóm -CH3), theo đó LINE-1 bị methyl hóa cao ở tế bào bình thường. Tuy nhiên, trong một số loại ung thư như phổi, vú, dạ dày, gan, trực tràng... sự thay đổi tình trạng methyl hóa LINE-1 đã được ghi nhận. Để nghiên cứu tình trạng methyl hóa của trình tự LINE-1, chúng tôi sử dụng kĩ thuật real-time khuếch đại đặc hiệu methyl. Kĩ thuật này cần có đối chứng chuẩn để định lượng tỉ lệ methyl hóa. Từ DNA methyl hóa thương mại, chúng tôi nhân dòng phân tử (tách dòng) hai vùng trong promoter của LINE-1 tương ứng với hai trình tự tham chiếu không chứa CpG và trình tự có 6 vị trí CpG bị methyl hóa. Kết quả chúng tôi đã tạo ra được hai plasmid tái tổ hợp pREF-LINE1 và pMe-LINE1. Các plasmid được mở vòng dạng thẳng, phối trộn theo tỉ lệ 10% methyl hóa và có thể được sử dụng làm đối chứng chuẩn để phân tích các mẫu bệnh phẩm.

1. Đọc trực tuyến

1. Đọc trực tuyến

Tạo bộ sưu tập với mã QR