Bài viết phân tích sự phát triển mạnh mẽ và những đóng góp to lớn của các KCN là tương đối nổi bật. Tuy nhiên, bên cạnh những đóng góp tích cực, quá trình phát triển công nghiệp nói chung và hệ thống các KCN ở Thanh Hóa nói riêng đang đặt ra nhiều thách thức lớn về ô nhiễm môi trường do chất thải rắn, nước thải và khí thải công nghiệp. Ô nhiễm môi trường nước do nước thải từ KCN trong những năm gần đây đã trở thành vấn đề gây bức xúc. Do vậy, cần phải có những giải pháp cho phát triển khu công nghiệp tỉnh Thanh Hóa theo hướng tăng trưởng xanh.