Nghiên cứu mô tả cắt ngang, phân lập và nuôi cấy 119 chủng vi khuẩn đường ruột thường gặp từ phân, đất và nước thải tại 10 trang trại chăn nuôi Lợn và Gà miền Nam Việt Nam nhằm khảo sát tỷ lệ gen MCR bằng kỹ thuật multiplex PCR với mồi tự thiết kế phát hiện cùng lúc 7 biến thể khác nhau của gen này. Kết quả: Tỉ lệ vi khuẩn đường ruột mang gen MCR là 34,5%, trong đó E. coli 23,5%, K. pneumoniae 9,2%, Enterobacter spp. và Salmonella spp. chiếm 1,8%, chưa tìm thấy gen kháng ở Serratia marcescens, Citrobacter spp. Hơn 97,5% gen MCR-1, có 1 chủng mang 2 gen MCR-1 và MCR-3. Kết luận: Điều này cho thấy, trong môi trường từ các cơ sở chăn nuôi có sử dụng thức ăn công nghiệp, MCR tồn tại trong nhiều loài vi khuẩn khác nhau với 2 gen phổ biến là MCR-1 và MCR-3. Đây có thể được xem là nguồn chứa lớn các gen kháng colistin ít được quan tâm, có thể gây ra mối nguy tiềm tàng đối với sức khỏe con người.