Phân tích dịch tễ học phân tử chủng virut đường ruột typ 71 (EV71) thường gây bệnh loét mồm miệng chân tay kèm theo hội chứng thần kinh trung ương và có khả năng gây viêm não, gây liệt giống bại liệt. Kết quả phân tích tại Hà Tây năm 2003 cho thấy EV71 thuộc nhóm gen C, phân nhóm gen C4, có quan hệ gần gũi với chủng EV71 phân lập được ở Thượng Hải, Trung Quốc năm 2000. Chủng virut EV71 phân lập ở miền Bắc và miền Nam Việt Nam cùng thuộc nhóm gen C nhưng thuộc 2 phân nhóm khác nhau (C4 và C1)