Để có cơ sở nhằm đánh giá hiện trạng sự đa dạng sinh học cho hệ sinh thái vùng cửa sông Bạch Đằng và Ba Lạt, cần nghiên cứu xây dựng các chỉ số quan trắc về đa dạng sinh học, xây dựng quy trình, các bước tiến hành khảo sát, đánh giá. Trên cơ sở đó, xếp loại chúng, xây dựng kế hoạch, biện pháp khai thác, sử dụng hợp lý và phát triển bền vững nguồn lợi sinh vệt hệ sinh thái vùng cửa sông Bạch Đằng và Ba Lạt.