Tiền thân là Viện Thí nghiệm vật liệu được thành lập từ năm 1956, những năm gần đây, Viện Khoa học và Công nghệ Giao thông Vận tải đã chủ động đẩy mạnh hoạt động Khoa học và Công nghệ, luôn giữ vững vị trí là một cơ quan nghiên cứu, ứng dụng Khoa học và Công nghệ Giao thông Vận tải hàng đầu, đóng góp thiết thực vào sự phát triển của ngành và đất nước.