Các công trình thoát nước cản trở sự di chuyển của các loài thủy sinh, đặc biệt là cá, dẫn đến số lượng các loài bị giảm đi đáng kể. Hiện nay, trên thế giới khi xây dựng các công trình đã đưa yêu cầu về thiết kế sinh học vào các quy định đối với các khu bảo tồn. Vườn Quốc gia Phú Quốc có nhiều sông suối, nơi đây tồn tại loài cá trình suối quý hiếm đang có nguy cơ bị giảm số lượng do ảnh hưởng của việc xây dựng công trình thoát nước và một số hoạt động xây dựng khác. Bài báo dựa trên số lượng nghiên cứu trong dự án cải tạo Vườn Quốc gia Phú Quốc, sử dụng phần mềm HY-8 với mô - đun AOP tính thử nghiệm và đề xuất dạng cống cho phép cá đi qua. Kết quả cho thấy, loại cống hộp, đáy làm việc như điều kiện tự nhiên và giải pháp hố trú ngụ cho cá ở phía hạ lưu giúp việc giải quyết bài toán thoát lũ và bảo tồn đa dạng sinh học hiệu quả hơn.