Đới Phan Si Pan chịu nhiều biến dạng trong Kainozoi liên quan với chuyển dịch do trượt bằng trái của đới đứt gãy Sông Hồng, Granit Yê Yên Sun cũng bị biến dạng đồng thời. Pha nguội trên toàn đới Phan Si Pan xảy ra khoảng 35 tr.n trước, kéo đến 32 tr.n. Giai đoạn nguội nhanh xảy ra tương ứng với 28 tr. n đối với granit Yê Yên Sun, 27 tr.n. với granit Posen, 25 tr.n với granit mặt cắt Bát Xát, Tuổi nguội dần tăng từ đông bắc sang tây nam theo phương vuông góc với đứt gãy Sông Hồng. Các đá biến chất thuộc phực hệ Ca Vịnh, phần trong của khối batolit Posen không bị biến dạng. Chúng được coi là cấu tạo khúc dồi bị phân cắt do các đứt gãy phá huỷ dịch trái.