Xác định được 3 loài dơi ngựa thuộc giống Pteropus tại Việt Nam: dơi ngựa bé Pteropus hypomelanus, dơi ngựa thái lan Pteropus lylei và dơi ngựa lớn Pteropus vampyrus. Từ năm 2001 trở lại đây, đã ghi nhận được loài dơi ngựa thái lan và dơi ngựa lớn ở tỉnh Thừa Thiên Huế. Cả 3 loài dơi ngựa thuộc giống Pteropus phân bố từ tỉnh Thừa Thiên Huế vào phía Nam, chủ yếu ở các tỉnh miền Tây Nam bộ, đặc biệt chúng cư trú trong khuôn viên một số ngôi chùa ở tỉnh Sóc Trăng. Số lượng quần thể các loài dơi đang bị suy giảm nghiêm trọng do các hoạt động săn bắt làm thực phẩm và bị tàn phá nơi cư trú.