Chuyển dịch cơ cấu nông nghiệp những năm qua đã đạt được những thành tựu đáng kể, tuy nhiên vẫn còn một số tồn tại. Có nhiều nguyên nhân dẫn đến chuyển dịch cơ cấu nông nghiệp còn chậm, có thể khái quát hai nguyên nhân chính: cơ sở hạ tầng cho phát triển nông nghiệp còn thấp kém, lạc hậu
chính sách đầu tư cho nông nghiệp chưa hợp lý. Từ những nguyên nhân và tồn tại này đề ra mục tiêu và định hướng chuyển dịch cơ cấu nông nghiệp trong thời gian tới.